| 檢 錄 | 水 道 | 單 位 | 選 手 | 參賽成績 | 比賽成績 | 名 次 | 總名次 | 備 註 |
| 1 | 臺灣師大 | 3199 李昭奕
3198 徐士棋
3202 李睿濱
3193 王昱程 | 04:00.14 | | | | |
| 2 | 海洋大學 | 3205 陳奕宏
3208 江浩宇
3206 張宇樂
3207 黃毓傑 | 03:58.89 | | | | |
| 3 | 臺灣大學 | 3184 鄭祺平
3178 方鈺學
3180 褚家帆
3182 温柏翔 | 03:58.52 | | | | |
| 4 | 輔仁大學 | 3277 徐傳玗
3273 陳玠丞
3276 陳琮尹
3272 王宇宸 | 03:55.00 | | | | |
| 5 | 高雄科大 | 3109 李侑勳
3114 張晏鑫
3111 楊博維
3113 黃嘉笙 | 03:55.71 | | | | |
| 6 | 台北海大 | 3006 曾趙子勛
3008 王浩宇
3007 楊之奎
3005 曾趙又霆 | 03:58.88 | | | | |
| 取消資格 | 7 | 義守大學 | 3262 莊誥誌
3258 林建均
3259 蔡易呈
3261 林宇宸 | 03:59.78 | | | | |
| 8 | 東華大學 | 3078 曾柏銘
3077 李康丞
3083 王維安
3084 林哲丞 | 04:02.82 | | | | |
| (9) | -臺北科大 | | | | | 預04:03.23 | |
| (10) | -陽明交大 | | | | | 預04:04.40 | |